Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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USP18Q9UMW8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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USP18Q9UMW8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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USP18Q9UMW8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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USP18Q9UMW8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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USP18Q9UMW8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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USP18Q9UMW8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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USP18Q9UMW8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP18Q9UMW8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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USP18Q9UMW8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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USP18Q9UMW8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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USP18Q9UMW8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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USP18Q9UMW8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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