Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DENND2AQ9ULE3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms