Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF3C4Q9UKN8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms