Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXO3Q9UK99 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO3Q9UK99 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms