Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD3Q9UJU5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms