Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PUF60Q9UHX1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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