Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO40Q9UH90 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms