Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF2Q9UG63 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCF2Q9UG63 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms