Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFDP1Q9UEE9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFDP1Q9UEE9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms