Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDH10Q9P2E7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms