Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK12Q9NYV4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK12Q9NYV4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms