Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ABCC13Q9NSE7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCC13Q9NSE7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms