Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HELLSQ9NRZ9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms