Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ASCL3Q9NQ33 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ASCL3Q9NQ33 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms