Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE7BQ9NP56 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms