Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SEBOXQ9HB31 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms