Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP4Q9C0A0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms