Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF1Q9BZW5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM6SF1Q9BZW5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms