Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTNAP3Q9BZ76 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms