Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms