Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCAPERQ9BY12 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCAPERQ9BY12 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms