Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RNF17Q9BXT8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNF17Q9BXT8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms