Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTA3Q9BTC8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms