Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPN18Q99952 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN18Q99952 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms