Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ALS2Q96Q42 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2Q96Q42 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms