Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNGAP1Q96PV0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGAP1Q96PV0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms