Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E2Q96LR5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms