Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJD4Q96KN9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJD4Q96KN9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms