Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LRRIQ1Q96JM4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRIQ1Q96JM4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRIQ1Q96JM4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
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