Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COG3Q96JB2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COG3Q96JB2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms