Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCC12Q96J65 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCC12Q96J65 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms