Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC34Q96HJ3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC34Q96HJ3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms