Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRP36Q96EU6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms