Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTERF3Q96E29 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms