Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRQ92752 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRQ92752 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRQ92752 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRQ92752 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRQ92752 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRQ92752 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRQ92752 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRQ92752 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRQ92752 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRQ92752 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRQ92752 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRQ92752 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRQ92752 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms