Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RABGGTAQ92696 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RABGGTAQ92696 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RABGGTAQ92696 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RABGGTAQ92696 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RABGGTAQ92696 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RABGGTAQ92696 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGGTAQ92696 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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