Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYCP3Q8IZU3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms