Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNL1Q8IU54 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNL1Q8IU54 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms