Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT27Q7Z3Y8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT27Q7Z3Y8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms