Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XIRP1Q702N8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms