Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR3Q6ZT12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR3Q6ZT12 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms