Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC41PQ6P2S7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms