Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C9orf84Q5VXU9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C9orf84Q5VXU9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms