Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF6Q5VXH4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms