Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF18Q5VWM3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF18Q5VWM3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms