Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf53Q5VUE5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1orf53Q5VUE5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms