Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF17Q5VTA0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms