Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOGA3Q5TF21 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SOGA3Q5TF21 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms