Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP188Q5SRE5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP188Q5SRE5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms