Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFT2D3Q587I9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms